微生物学已经揭示了细胞内和细胞间正在进行的网状进化过程和复杂的相互作用。这些现象以真实的生物网络为特征，可以使用基于网络的工具对其进行逻辑分析。因此，网络科学，一个独立于进化生物学和微生物学的领域，最近广泛地渗透到这两个领域。重要的是，网络工具获得的观察结果，增强了对变异、适应和遗传这三个核心进化概念的理解。加拿大蒙特利尔大学的弗朗索瓦·帕培尔等研究人员展示了网络科学如何通过在多种单元间自然选择来解释进化论，试图更新达尔文关于生命树的进化理论。