基因组序列以两种古老的人类（尼安德特人和丹尼索瓦人）而闻名，当他们分散到非洲之外时，它们与解剖学上的现代人类杂交。新加坡南洋理工大学的居伊·雅各布斯等研究人员，在东南亚岛屿和新几内亚的14个岛群的161个新基因组中鉴定出了高度可信的古老单倍型，并发现了与单一的丹尼索瓦人起源不一致的大量DNA片段。相反，现代巴布亚人携带着数百种基因变体，来自两种截然不同的丹尼索瓦人血统，这两种血统在35万年前就已经分离了。这些谱系之间的时空结构表明，从这些丹尼索瓦族中有一个种群的入侵主要发生在华莱士线以东，并一直持续到更新世末期。第三个丹尼索瓦血统出现在现代东亚。这幅区域拼图表明，远古时代的接触相当复杂，现代人与多个丹尼索瓦族群杂交。

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