在青海省三江源,藏羚经过青藏线。 李新风/视觉中国 |
科技日报讯 (记者张蕴)12月16日,记者从中国科学院西北高原生物研究所获悉,该研究所研究员张同作联合青海大学副教授魏青团队,成功组装了藏羚染色体级别的基因组,首次获得藏羚染色体水平的高质量基因组和注释信息。相关结果发表在国际学术期刊《自然》旗下的综合性科学期刊《科学数据》上。
张同作介绍,藏羚不仅是世界上分布海拔最高的反刍动物之一,也是青藏高原唯一具有长距离迁徙行为的物种,是研究高海拔适应性机制和迁徙行为的良好模型。然而迄今为止,公开数据库中仍缺少藏羚高质量的染色体水平基因组,限制了基于遗传特征解析其物种适应、进化及种群生态相关工作的开展。
为攻克这一难题,研究团队基于多种基因组测序技术,成功组装了藏羚染色体级别的基因组。数据显示,组装后的基因组连续性好,且完整度和准确性高。此外,研究团队利用蛋白质同源预测、蛋白质从头预测和深度学习等多种方式,在藏羚基因组上共注释到28330个功能基因。
张同作说,此次成功组装藏羚染色体级别的基因组,将为藏羚的适应进化遗传机制、保护遗传学研究及进一步探索物种迁徙行为的遗传机制提供重要基因组资源。