肠道菌群除了在宿主代谢和免疫调节中发挥重要作用外，在中枢神经系统和肠道神经系统之间的双向通讯系统——肠脑轴中也发挥着重要作用。中国国家蛋白质科学中心（北京）的张培（音译）等研究人员对喂食两种不同益生菌的小鼠的脑肽和肠道微生物群进行了分析。结果发现，益生菌改变了许多神经肽的丰度，其方式与肠道微生物群组成的变化有关，因脑区而异，并取决于益生菌种类、益生菌是活的还是灭活的，以及食用益生菌的时间长短。这些组学数据集为将来研究肠道微生物群与神经肽控制的认知、行为和生理过程之间的关系奠定了基础。