在广东省政府大力支持和推动下，广东省科学院积极探索体制机制改革，激发创新活力，聚焦广东省产业的发展需求，开展基础研究和应用技术研究，推动产业科技成果孵化、培育和产业化，满足经济社会发展需求。采取了一系列改革措施。

    施行编制改革。广东省科学院是省直属事业单位但施行企业化运作，编制变成员额，既保留事业单位的优势，又赋予企业单位的灵活机制。广东省科学院的编制员额由院层面掌控，每个所可根据发展的实际需要调控编制。赋予决策自主权。广东省政府赋予科学院自主设立下属事业单位、研究机构的权力。例如广东省科学院要成立一个数学所，院内开会决定、报省编办备案即可，不需要向省里报批。突破绩效奖励束缚。广东省科学院绩效奖励不受事业单位原有管理的束缚。科学家的工资可以根据需要无限提高，没有事业单位的工资比例、工资总额限制。设立专项基金。广东省政府每年给广东省科学院3个亿专项资金，用于培育引进人才，提升平台能力，提升科研实力。