由北京市农林科学院蔬菜平台牵头，联合了中国农业科学院、深圳华大基因科技有限公司、美国康奈尔大学、荷兰瑞克斯旺等优势单位，共同完成了世界首张西瓜基因组序列图谱绘制与破译，获得了高质量的西瓜基因组序列图谱，成为由中国主导完成的世界第一张西瓜基因组序列图谱。该研究成果于2012年11月25日在国际学术顶级刊物《自然·遗传学》（影响因子为35.532）上在线发表。这是植物基因组领域研究的又一重大突破性成果，标志着我国西瓜基因组学研究取得了国际领先地位。

    西瓜是全球重要的经济作物和夏季消暑水果，但就是这样一种常见的水果，人们却始终未能从内到外了解它。北京市农林科学院蔬菜研究中心主任许勇研究员,牵头进行了一项名为“国际西瓜基因组计划”的科学研究。科学家们采用“全基因组鸟枪法”测序策略，得到总量约为46G的基因序列数据，打开了西瓜生命活动的“黑匣子”。

    这支科研团队发现，拼接后的序列覆盖83.2%的西瓜基因组，共鉴定出约23440个基因，其中96.8%的基因已经精确定位到染色体上。分析表明:现代栽培西瓜11对染色体是由21对祖先染色体经过复杂的断裂和融合过程进化而来。这项突破对推动西瓜育种和生产具有重大意义，也为破解葫芦科作物基因组研究奠定了基础。