科技日报讯 (记者马波)中科院昆明动物研究所张亚平院士以及车静研究员课题组与华大基因国家基因库及德克萨斯大学奥斯汀分校等单位合作,成功破译了首个“现代蛙类”——高山倭蛙的基因组。
研究人员估算高山倭蛙和热带爪蟾的分歧时间大概在266百万年前。尽管两者分歧时间很久,但是两物种染色体间的重排特别少,说明蛙类基因组可能具有相对较慢的进化速率。这一猜想在染色体内部重排速率、基因区及全基因组的替换速率等多个层面都得到证实,即两栖动物,甚至整个冷血动物,具有比恒温动物更低的进化速率。
高山倭蛙基因组的破译,使我们进一步确认了更多的人类、鸟类、蛙类基因组中的染色体断裂和融合区域,同时也鉴定了两栖动物中高度保守的区域,为后续的两栖动物比较基因组学提供了良好的研究基础。尽管四足动物有3.6亿年的进化史,在人的染色体中仍可以看到较长的祖先序列被完整保留下来。通过分析染色体断裂,融合事件,发现人的染色体间重排最剧烈,鸡和两栖动物染色体间重排相对较少。最后,该研究还发现了高山倭蛙特有的三类抗菌肽(AP01357,AP00097,和AP01583),其中AP01583已被证实在氧化应激和应对病原微生物方面具有重要作用,这些特有抗菌肽的存在可能在高山倭蛙适应高海拔环境中起一定保护作用。